Pokémon Puzzle Challenge es un juego lanzado por Intelligent Systems conjuntamente con Creatures y Gamefreak, este juego salió junto a Pokémon Puzzle League para Nintendo 64. El juego fue lanzado en el año 2000. En él, aparecen los Pokémon de las conocidas versiones de Game Boy Pokémon Oro, Plata y Cristal. El juego se basa como en los conocidos juegos como Tetris Atack, en el jugador debe formar cadenas y evitar que los bloques lleguen al final de la pantalla. Se pueden hacer combos combinando bloques del mismo color, existen combos desde 4 hasta 8 bloques, cuantos más combos se hagan, más daño recibe el enemigo, y mientras más grande sea el combo antes terminará la partida. Para el modo de 1 jugador, Cyndaquil, Chikorita y Totodile serán los iniciales de nuestro personaje; pero se pueden conseguir más Pokémon para la aventura, siempre antes que Débora. Eso significa, que cuantos más Pokémon tengas, más vidas tendrás.